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基于转录因子结合位点的特性对转录因子分类的新方法
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基于转录因子结合位点的特性对转录因子分类的新方法
论文目录
摘要
第1-9页
ABSTRACT
第9-10页
前言
第10-11页
第1章 绪论
第11-18页
·转录因子(TF)与转录因子结合位点(TFBS)
第11页
·转录因子分类的研究意义
第11-12页
·转录因子分类的研究现状
第12-14页
·基于DNA结合域对转录因子分类
第12-13页
·基于转录起始的必要性对转录因子分类
第13-14页
·转录因子结合位点的识别特性
第14-15页
·用于转录因子分类的方法
第15-18页
·隐马尔可夫模型
第16页
·最近邻算法(NNA)
第16-18页
第2章 转录因子的向量表示
第18-24页
·转录因子结合位点的长度
第18-19页
·新的位置频率值
第19-20页
·不保守的转录因子结合位点的比率
第20-21页
·非核小体位置的转录因子结合位点的比率
第21-22页
·既保守又在核小体位置的转录因子结合位点比率
第22页
·GC含量
第22-24页
第3章 用支持向量机对转录因子分类
第24-27页
·支持向量机
第24-25页
·支持向量机在生物信息学中的应用
第25页
·支持向量机用于转录因子分类
第25-27页
第4章 实验
第27-36页
·实验数据来源
第27-29页
(1) 转录因子结合位点的序列结构信息和位置信息
第27页
(2) 转录因子结合位点所在DNA区域的保守性信息
第27-28页
(3) 全基因组序列的核小体位置信息
第28-29页
·实验过程
第29-33页
·实验结果校验
第33-36页
·全检验法
第33页
·留一法交叉检验
第33页
·ROC曲线
第33-36页
第5章 总结和讨论
第36-38页
·总结
第36页
·讨论
第36-38页
参考文献
第38-42页
致谢
第42-43页
攻读学位期间发表的学术论文
第43-44页
学位论文评阅及答辩情况表
第44页
论文编号
BS1672275
,这篇论文共
44
页
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15.4
元。 直接购买按0.5元/页下载,共需要支付
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