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LINCS生物大数据解读与分析 |
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| 论文目录 |
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| 摘要 | 第8-10页 | | ABSTRACT | 第10-11页 | | 第一章 绪论 | 第12-23页 | | 1.1 课题研究的背景和意义 | 第12-15页 | | 1.2 国内外研究现状 | 第15-20页 | | 1.3 论文主要内容 | 第20-23页 | | 1.3.1 论文的主要工作 | 第20-21页 | | 1.3.2 论文的组织结构 | 第21-23页 | | 第二章 LINCS数据与基因集富集分析方法分解 | 第23-37页 | | 2.1 基因表达谱 | 第23-25页 | | 2.1.1 基因表达谱研究的意义 | 第23-24页 | | 2.1.2 差异表达基因 | 第24-25页 | | 2.2 LINCS数据的来源及其数据构成 | 第25-27页 | | 2.3 L1000技术 | 第27-30页 | | 2.3.1 Landmark基因 | 第27-28页 | | 2.3.2 数据产生及处理流程 | 第28-30页 | | 2.4 基因差异表达分析方法 | 第30-35页 | | 2.4.1 传统表达谱分析方法的局限性 | 第30-31页 | | 2.4.2 基因集富集分析方法 | 第31-32页 | | 2.4.3 GSEA方法 | 第32-35页 | | 2.5 本章小结 | 第35-37页 | | 第三章 基于LINCS基因沉默数据的基因扰动关系分析 | 第37-46页 | | 3.1 扰动关系网络的构建 | 第37-40页 | | 3.2 基因扰动关系与蛋白相互作用之间的关联 | 第40-41页 | | 3.2.1 基因扰动关系与直接蛋白相互作用 | 第40-41页 | | 3.2.2 基因扰动关系与间接蛋白相互作用 | 第41页 | | 3.3 基因扰动关系与KEGG信号通路和BP的关联分析 | 第41-42页 | | 3.4 进一步验证分析 | 第42-43页 | | 3.5 九个细胞系结果的一致性 | 第43-44页 | | 3.6 本章小结 | 第44-46页 | | 第四章 基于LINCS基因沉默数据的肝细胞基因新功能探索 | 第46-58页 | | 4.1 基于表达谱相似性的基因聚类 | 第46-48页 | | 4.2 社团印迹基因分析 | 第48-51页 | | 4.3 基因功能注释和富集分析 | 第51-53页 | | 4.4 基于表达谱相似性的基因功能推测 | 第53-57页 | | 4.5 本章小结 | 第57-58页 | | 第五章 结束语 | 第58-60页 | | 5.1 工作总结 | 第58-59页 | | 5.2 研究展望 | 第59-60页 | | 致谢 | 第60-62页 | | 参考文献 | 第62-67页 | | 作者在学期间取得的学术成果 | 第67-68页 | | 附录A 补充图表 | 第68-70页 | | 附录B 缩略词表 | 第70-71页 |
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论文编号BS3305925，这篇论文共71页
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