摘要 | 第4-6页 |
abstract | 第6-7页 |
第一章 引言 | 第12-22页 |
1.1 鸡白痢疾病 | 第12-14页 |
1.2 肠道微生物的发展 | 第14-15页 |
1.3 肠道微生物与人类疾病 | 第15-18页 |
1.4 微生物在疾病治疗中的作用 | 第18-21页 |
1.5 研究的目的和意义 | 第21-22页 |
第二章 材料和方法 | 第22-30页 |
2.1 实验设计和样本采集 | 第22-23页 |
2.1.1 实验动物和实验设计 | 第22-23页 |
2.1.2 样本采集 | 第23页 |
2.2 实验材料 | 第23-25页 |
2.2.1 实验试剂 | 第23-24页 |
2.2.2 实验仪器 | 第24-25页 |
2.3 鸡白痢阴阳性以及腹泻的鉴定 | 第25-26页 |
2.4 DNA提取和16S RDNA测序 | 第26-28页 |
2.4.1 DNA提取 | 第26页 |
2.4.2 16s rDNA测序 | 第26-28页 |
2.5 数据处理和生物信息学分析 | 第28-30页 |
2.5.1 数据过滤 | 第28页 |
2.5.2 序列聚类和注释 | 第28页 |
2.5.3 生物信息学分析 | 第28-30页 |
第三章 结果与分析 | 第30-59页 |
3.1 16S RDNA测序测序结果汇总 | 第30-36页 |
3.2 阴性鸡与阳性鸡的肠道微菌群组成 | 第36-39页 |
3.3 阳性亲本后代与阴性亲本后代的肠道菌群组成 | 第39-43页 |
3.4 非腹泻鸡与腹泻鸡的肠道菌群组成 | 第43-49页 |
3.4.1 阳性亲本的后代中非腹泻鸡与腹泻鸡的比较分析 | 第45-46页 |
3.4.2 阴性亲本的后代中非腹泻鸡与腹泻鸡的比较分析 | 第46-47页 |
3.4.3 阴性亲本后代中腹泻鸡与阳性亲本后代中腹泻鸡的比较分析 | 第47-48页 |
3.4.4 阴性亲本后代中非腹泻鸡与阳性亲本后代中非腹泻鸡的比较分析 | 第48-49页 |
3.5 微生物区系功能预测 | 第49-59页 |
第四章 讨论 | 第59-63页 |
4.1 宿主遗传基础与肠道菌群的关联 | 第59-60页 |
4.2 腹泻与肠道菌群的关联 | 第60-61页 |
4.3 益生菌和粪菌移植对鸡白痢疾病治疗的可能性讨论 | 第61-63页 |
第五章 结论 | 第63-64页 |
第六章 结束语 | 第64-66页 |
6.1 主要工作与创新点 | 第64页 |
6.2 后续研究工作 | 第64-66页 |
参考文献 | 第66-73页 |
附录 | 第73-80页 |
致谢 | 第80-81页 |
攻读硕士学位期间已发表或录用的论文 | 第81-83页 |