摘要 | 第7-9页 |
Abstract | 第9-11页 |
缩略词表 | 第12-13页 |
第一章 文献综述 | 第13-31页 |
1.1 葡萄病毒病害的发生与危害 | 第13-17页 |
1.1.1 葡萄卷叶病的发生与危害 | 第13-14页 |
1.1.2 葡萄扇叶退化病的发生和危害 | 第14-15页 |
1.1.3 葡萄皱木复合病的发生和危害 | 第15页 |
1.1.4 其它葡萄病毒病的发生与危害 | 第15-17页 |
1.2 主要葡萄病毒种类及其分类地位 | 第17-21页 |
1.2.1 葡萄卷叶相关病毒 | 第18页 |
1.2.2 葡萄扇叶退化病相关病毒 | 第18-19页 |
1.2.3 葡萄皱木复合病相关病毒 | 第19-20页 |
1.2.4 近几年新报道的葡萄病毒 | 第20-21页 |
1.3 葡萄病毒的鉴定方法 | 第21-25页 |
1.3.1 指示植物鉴定法 | 第21-22页 |
1.3.2 ELISA检测方法 | 第22页 |
1.3.3 RT-PCR检测方法 | 第22-23页 |
1.3.4 分子杂交检测方法 | 第23-24页 |
1.3.5 逆转录环介导恒温扩增检测技术 | 第24-25页 |
1.3.6 高通量测序方法 | 第25页 |
1.4 植物病毒的遗传多样性 | 第25-28页 |
1.4.1 RNA病毒的进化 | 第26页 |
1.4.2 病毒的基因重组 | 第26-27页 |
1.4.3 葡萄卷叶相关病毒遗传多样性研究 | 第27-28页 |
1.5 我国葡萄病毒的发生及研究概况 | 第28-29页 |
1.6 本研究的目的和意义 | 第29-31页 |
第二章 我国葡萄卷叶相关病毒的检测及其遗传多样性分析 | 第31-58页 |
2.1 材料和方法 | 第31-38页 |
2.1.1 植物材料 | 第31-32页 |
2.1.2 所用试剂 | 第32页 |
2.1.3 RNA提取 | 第32-33页 |
2.1.4 RT-PCR和RT-n PCR检测 | 第33-35页 |
2.1.5 基因克隆与测序 | 第35-37页 |
2.1.6 序列分析 | 第37-38页 |
2.2 结果与分析 | 第38-55页 |
2.2.1 GLRa V-1、4、7 的RT-PCR和RT-n PCR检测结果 | 第38页 |
2.2.2 不同葡萄栽培品种的病毒检测结果 | 第38-39页 |
2.2.3 GLRa V-1 的基因变异及遗传多样性分析 | 第39-46页 |
2.2.4 GLRa V-4 的基因变异及遗传多样性分析 | 第46-50页 |
2.2.5 GLRa V-7 的基因变异及遗传多样性分析 | 第50-55页 |
2.3 讨论 | 第55-58页 |
第三章 引起葡萄环斑症状的病原病毒种类鉴定 | 第58-86页 |
3.1 材料和方法 | 第59-69页 |
3.1.1 植物材料 | 第59页 |
3.1.2 所用试剂 | 第59-60页 |
3.1.3 小RNA测序及数据分析 | 第60页 |
3.1.4 双生病毒基因组的PCR扩增 | 第60-62页 |
3.1.5 RCA扩增及其产物的酶切鉴定 | 第62页 |
3.1.6 酶切产物的克隆及测序 | 第62-64页 |
3.1.7 GINV基因组的PCR扩增 | 第64-66页 |
3.1.8 GINV基因组 5’和 3’末端序列扩增 | 第66-68页 |
3.1.9 葡萄样品中GLGV的检测 | 第68页 |
3.1.10 基因克隆及测序 | 第68页 |
3.1.11 序列分析 | 第68-69页 |
3.2 结果与分析 | 第69-83页 |
3.2.1 葡萄样品的小RNA测序结果 | 第69-72页 |
3.2.2 安尼斯基葡萄样品中双生病毒基因组PCR扩增及测序 | 第72-73页 |
3.2.3 双生病毒的RCA扩增、酶切鉴定及测序 | 第73-74页 |
3.2.4 双生病毒的基因组及序列分析 | 第74-75页 |
3.2.5 GLGV与其他双生病毒成员的系统遗传进化树分析 | 第75-77页 |
3.2.6 安尼斯基和贝达葡萄样品中GINV的全长基因组及序列分析 | 第77-80页 |
3.2.7 GINV分离物与发状病毒属其他成员的系统进化树分析 | 第80-81页 |
3.2.8 来源GLGV和GINV的小RNA分析 | 第81-82页 |
3.2.9 葡萄样品中GLGV的检测结果 | 第82-83页 |
3.3 讨论 | 第83-86页 |
第四章 GINV中国分离物的检测及遗传多样性研究 | 第86-95页 |
4.1 材料和方法 | 第86-88页 |
4.1.1 植物材料 | 第86页 |
4.1.2 所用试剂 | 第86-87页 |
4.1.3 GINV中国分离物的RT-PCR检测 | 第87页 |
4.1.4 GINV分离物基因克隆测序及序列分析 | 第87-88页 |
4.2 结果与分析 | 第88-93页 |
4.2.1 葡萄样品中GINV的检测结果 | 第88页 |
4.2.2 GINV的基因序列分析 | 第88-91页 |
4.2.3 GINV分离物的基因系统进化分析 | 第91-93页 |
4.3 讨论 | 第93-95页 |
第五章 全文结论及展望 | 第95-97页 |
参考文献 | 第97-112页 |
附录1 GLRa V-1、4、7 的检测结果 | 第112-130页 |
附录2 田间无核白葡萄表现的环斑症状 | 第130-131页 |
附录3 葡萄潜隐双生病毒GLGV的全基因组及一个缺陷分子的基因序列 | 第131-132页 |
附录4 双生病毒属病毒的CP和Rep基因氨基酸序列的遗传进化树分析 | 第132-133页 |
附录5 中国GINV分离物LN_BETA_RS和LN_ANSJ_RS与日本分离物(D88448)的RP、MP和CP基因的氨基酸同源性比对图 | 第133-139页 |
附录6 195 个葡萄样品中GINV的检测结果 | 第139-148页 |
附录7 主要溶液配方 | 第148-149页 |
附录8 研究生期间已发表论文 | 第149-150页 |
致谢 | 第150-152页 |