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非小细胞肺癌生物标志物的定量蛋白质组学研究 |
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论文目录 |
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摘要 | 第1-9页 | Abstract | 第9-11页 | 前言 | 第11-17页 | 参考文献 | 第14-17页 | 第一章 高质量分泌蛋白质组学技术筛选非小细胞肺癌血清生物标志物 | 第17-41页 | 1 材料和方法 | 第17-23页 | ·化学试剂 | 第17-18页 | ·血清样本收集与制备 | 第18页 | ·细胞培养;细胞蛋白质组、分泌蛋白质组样本收集 | 第18-19页 | ·1维凝胶电泳和胶内酶解 | 第19页 | ·ELISA和Western杂交 | 第19-20页 | ·反向液相色谱质谱联合分析 | 第20页 | ·蛋白质的鉴定 | 第20-21页 | ·生物信息学分析 | 第21-23页 | ·分泌蛋白的预测和蛋白质的注释 | 第21页 | ·蛋白质非标记定量、系统聚类和主成份分析 | 第21页 | ·在线数据库 | 第21-22页 | ·两套独立测试数据集:血清蛋白质组学、基因芯片 | 第22-23页 | 2 结果 | 第23-33页 | ·1D凝胶电泳-液相色谱质谱技术创建的肺癌A549初始分泌蛋白质组数据集 | 第23-24页 | ·高质量分泌蛋白质组数据集的建立 | 第24-26页 | ·肺癌A549细胞株分泌蛋白质组的质量评估 | 第26-28页 | ·高质量分泌蛋白质组作为肺癌候选生物标志物的文献挖掘 | 第28-31页 | ·独立测试数据集评估高质量分泌蛋白质组 | 第31-32页 | ·PAI-1和C4BP在肺癌血清中的表达 | 第32-33页 | 3 讨论 | 第33-35页 | 参考文献 | 第35-41页 | 第二章 靶向蛋白质组学技术与鸟枪法研究非小细胞肺癌诊断及预后相关生物标志物 | 第41-67页 | 1 前言 | 第41-42页 | 2 材料和方法 | 第42-46页 | ·血清样本采集 | 第42页 | ·酶解 | 第42页 | ·一体柱色谱-串联质谱分析 | 第42-43页 | ·蛋白质的鉴定 | 第43页 | ·ELISA与非标记定量分析 | 第43页 | ·建立“MRM试剂盒” | 第43-44页 | ·生物信息学分析 | 第44-45页 | ·机器学习ELISA数据:“训练集-预测集”法 | 第45页 | ·组织芯片研究 | 第45-46页 | 3 结果 | 第46-55页 | ·实验流程 | 第46页 | ·非标记定量技术筛选出的非小细胞肺癌生物标志物 | 第46-50页 | ·利用ELISA数据构建一个肺癌血清生物标志物群 | 第50-52页 | ·靶向蛋白质组学技术建立“MRM”肺癌血清试剂盒 | 第52-53页 | ·5种蛋白质在细胞水平的表达量 | 第53-54页 | ·血清C4BP、SAA、LRGl浓度与肺癌预后的相关性 | 第54-55页 | 4 讨论 | 第55-57页 | 参考文献 | 第57-67页 | 论文目录 | 第67页 | 读博期间所获科研基金 | 第67-68页 | 附 发表论文 | 第68-79页 | 致谢 | 第79-80页 |
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