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基于HMM的转录因子结合位点识别方法研究
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基于HMM的转录因子结合位点识别方法研究
论文目录
摘要
第1-5页
ABSTRACT
第5-8页
第一章 引言
第8-13页
·生物信息学背景知识
第8-9页
·转录因子结合位点识别方法的研究目的与意义
第9-10页
·转录因子结合位点预测理论的研究现状
第10-11页
·本文主要内容
第11-13页
第二章 基本概念与原理
第13-19页
·基因表达和调控
第13-14页
·转录调控
第14-18页
·转录因子
第15-16页
·转录因子结合位点
第16-17页
·转录因子的类型
第17-18页
·本章小结
第18-19页
第三章 隐马尔科夫模型及其应用
第19-30页
·马尔可夫模型
第19-20页
·隐马尔可夫模型
第20-22页
·隐马尔可夫模型的基本问题和算法
第22-27页
·前向算法和后向算法
第22-24页
·Viterbi 算法
第24-25页
·Baum-Welch(EM)算法
第25-27页
·隐马尔可夫模型生物信息学中应用
第27-29页
·剖面隐马尔科夫模型(profile HMM)
第27-28页
·隐马尔科夫模型在识别基因上的应用
第28-29页
·隐马尔科夫模型的优缺点
第29页
·本章小结
第29-30页
第四章基于HMM 的转录因子结合位点识别
第30-40页
·数据的选取
第30-31页
·新隐马尔科夫模型框架的构建
第31-32页
·相关位置得分函数
第32-36页
·碱基相关性的表示计算方法
第32-35页
·本文采用的碱基相关性计算标准
第35-36页
·应用新模型识别转录因子结合位点
第36-39页
·算法流程
第36-37页
·实验结果统计分析
第37-39页
·本章小结
第39-40页
第五章 结论
第40-42页
·总结
第40页
·展望
第40-42页
参考文献
第42-46页
致谢
第46-47页
在学期间公开发表论文及著作情况
第47页
论文编号
BS612992
,这篇论文共
47
页
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