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四种雀形目鸟类线粒体基因组与长尾山雀属比较线粒体基因组学研究 |
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| 摘要 | 第1-5页 | | Abstract | 第5-10页 | | 第一部分 前言 | 第10-22页 | | 1 动物线粒体基因组结构组成 | 第10页 | | 2 动物线粒体基因组的基因排列顺序变化 | 第10-13页 | | ·重排模型 | 第11-12页 | | ·两种模型的比较 | 第12-13页 | | ·重排的应用 | 第13页 | | 3 鸟纲及雀形目系统发育研究进展 | 第13-19页 | | ·鸟纲的系统发育研究 | 第13-15页 | | ·雀形目系统发育研究进展 | 第15-16页 | | ·山雀与长尾山雀的系统发育研究进展 | 第16-19页 | | 4 研究物种简介 | 第19-21页 | | ·黄眉林雀简介 | 第19页 | | ·长尾山雀简介 | 第19-21页 | | 5 研究的目的和意义 | 第21-22页 | | 第二部分 实验材料与方法 | 第22-32页 | | 1 实验材料 | 第22-24页 | | ·实验标本的采集、保存与鉴定 | 第22页 | | ·实验仪器及试剂 | 第22-24页 | | 2 实验方法 | 第24-27页 | | ·总DNA提取及总DNA检测 | 第24页 | | ·PCR所需引物设计及扩增 | 第24-27页 | | ·PCR产物测序 | 第27页 | | 3 数据处理及结果分析 | 第27-29页 | | ·线粒体基因组序列的组装 | 第27-28页 | | ·线粒体基因组全序列所含基因定位及注释 | 第28页 | | ·线粒体全基因组组成情况的分析 | 第28页 | | ·RNA基因二级结构预测 | 第28-29页 | | 4 基于线粒体基因的雀形目鸟类系统发育分析 | 第29-32页 | | ·数据来源 | 第29-30页 | | ·序列处理 | 第30页 | | ·系统发育信号的检测及系统树的构建 | 第30-32页 | | 第三部分 实验结果 | 第32-34页 | | 1 物种总DNA提取结果 | 第32页 | | 2 L-PCR扩增及纯化结果 | 第32-33页 | | 3 Sub-PCR扩增及纯化结果 | 第33页 | | 4 序列的拼接 | 第33-34页 | | 第四部分 4种雀形目鸟类的线粒体基因组的组成及分析 | 第34-66页 | | 1 黄眉林雀的线粒体基因组的组成及分析 | 第34-42页 | | ·基因组的排序 | 第34-36页 | | ·基因间隔区与重叠区 | 第36页 | | ·全基因组碱基组成特征 | 第36页 | | ·蛋白编码基因的密码子使用情况和氨基酸组成统计 | 第36-37页 | | ·tRNA基因的二级结构预测结果 | 第37-38页 | | ·rRNA基因的二级结构预测结果 | 第38页 | | ·控制区 | 第38-42页 | | 2 红头长尾山雀的线粒体基因组的组成及分析 | 第42-50页 | | ·基因组的排序 | 第42页 | | ·基因间隔区与重叠区 | 第42-44页 | | ·全基因组碱基组成特征 | 第44页 | | ·蛋白编码基因的密码子使用情况和氨基酸组成统计 | 第44-45页 | | ·tRNA基因的二级结构预测结果 | 第45页 | | ·rRNA基因的二级结构预测结果 | 第45-46页 | | ·控制区 | 第46-50页 | | 3 黑眉长尾山雀的线粒体基因组的组成及分析 | 第50-58页 | | ·基因组的排序 | 第50页 | | ·基因间隔区与重叠区 | 第50-52页 | | ·全基因组碱基组成特征 | 第52页 | | ·蛋白编码基因的密码子使用情况和氨基酸组成统计 | 第52-53页 | | ·tRNA基因的二级结构预测结果 | 第53页 | | ·rRNA基因的二级结构预测结果 | 第53-54页 | | ·控制区 | 第54-58页 | | 4 银喉长尾山雀的线粒体基因组的组成及分析 | 第58-66页 | | ·基因组的排序 | 第58页 | | ·基因间隔区与重叠区 | 第58-60页 | | ·全基因组碱基组成特征 | 第60页 | | ·蛋白编码基因的密码子使用情况和氨基酸组成统计 | 第60-61页 | | ·tRNA基因的二级结构预测结果 | 第61页 | | ·rRNA基因的二级结构预测结果 | 第61-62页 | | ·控制区 | 第62-66页 | | 第五部分 长尾山雀比较基因学研究及系统位置的讨论 | 第66-81页 | | 1 长尾山雀比较基因学研究 | 第66-74页 | | ·长尾山雀线粒体基因组结构比较 | 第66-68页 | | ·长尾山雀线粒体基因组的差异比较 | 第68-72页 | | ·长尾山雀属的简约法分析 | 第72-74页 | | ·总结 | 第74页 | | 2 雀形目的系统发育分析及长尾山雀系统位置分析 | 第74-81页 | | ·系统发育信号检测 | 第75页 | | ·不同数据集构建的系统发育树 | 第75-79页 | | ·分析与讨论 | 第79-81页 | | 第六部分 脊椎动物线粒体基因组排序变化及重组的研究 | 第81-95页 | | 1 脊椎动物线粒体基因组的典型排序及数量统计 | 第81-82页 | | 2 脊椎动物各纲内的线粒体基因排序变化 | 第82-90页 | | ·圆口纲 | 第82页 | | ·软骨鱼类 | 第82页 | | ·硬骨鱼类 | 第82-84页 | | ·两栖纲 | 第84-86页 | | ·爬行纲 | 第86-89页 | | ·鸟纲 | 第89-90页 | | ·哺乳纲 | 第90页 | | ·重排的热点及高频基因 | 第90页 | | 3 各种重排现象及与之对应的模型 | 第90-92页 | | ·串联重复-随机删除模型 | 第90-91页 | | ·重组模型 | 第91-92页 | | 4 从基因排序到系统发育 | 第92-94页 | | 5 脊索动物线粒体基因组原始排序的推测 | 第94-95页 | | 总结 | 第95-97页 | | 参考文献 | 第97-114页 | | 致谢 | 第114-115页 | | 攻读硕士学位期间的研究成果 | 第115页 |
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论文编号BS1748743，这篇论文共115页
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